21世(shì )纪初，人(👓)类将多(💪)数人留在被哥(gē )斯拉蹂躏的(de )(🔔)地球(🤲)上，仅使(💠)被选中的(🤳)人(rén )们乘(🕐)上恒星间移民船(chuán )·(🌮)阿(ā )拉特拉姆(❕)，前往能够(gòu )移居的(🛎)“约定之地·(🈸)τ(➡)星(🏻)e”。但(dàn )这一计划失败(bài )，人(rén )类(💹)只(zhī )得(🐩)再度返回地(dì )球。而(ér )长(🈺)距离亚空(kōng )间航(háng )行(háng )所引发的时空歪(wāi )曲(qǔ )，导(🥅)致人(🍽)类回(🔞)到的(de )地方变成了“两万年后的地(🔥)球”。在这个(gè )地球(qiú )，主人公·(👗)晴男等(děng )人(rén )在遭(🐂)受哥斯拉袭击的同时，与埃克(🎴)西弗、(🚩)比(🍹)尔沙尔德两(🈺)种(zhǒng )族的异星人共同实行谋划(huá )了20年的(de )(💛)“对哥斯拉(lā )战术”，通过殊死战(zhàn )斗(dòu )成功击倒了哥斯拉。
(🤯) 但喜(⏫)悦并未持(chí )续(xù )(⤴)多久，深藏(🌻)地(dì )下的真正哥(🐁)斯拉“哥斯拉(lā )·地(🤺)球”现(xiàn )身了。两(🔉)万年(nián )间(jiān )持(👌)续成长生存(cún )、(🈵)身(shēn )(😎)高(gāo )300米、质量超(🚇)过(😀)10万(🍄)吨，在进化(huà )成(🥏)这(🕳)种姿态的超巨大哥(gē )斯拉压倒(dǎo )性(xìng )的(🐖)破坏力(🥖)面前(🐩)，晴男等人落花(huā )流(liú )(💦)水。
拯救了晴男的(💺)是(shì )被视(shì )为人类的残存者(😿)“弗(🙃)图亚”之民，米(📘)亚(yà )娜。弗(📼)图亚是他们(🐕)在(🤱)这个地球首次遇到的人型生(shēng )命种族。他们会是(shì )人类的(de )(🐇)子孙(🍶)吗——(📚)。“弗图(tú )亚的神(🧦)也被哥斯拉击(jī )破，如(rú )今只(zhī )剩下(👫)卵(luǎn )。挑(tiāo )战者(🏗)、(❎)抗(kàng )争者，全部被火焰吞噬而消失了”面对这(✏)样的他们，晴(qíng )男回(huí )应道(dào )(💝)“这是以人(🔙)类的双(🤯)手夺回地球的(de )最(zuì )后机会了”。
(♿)另一方面，比尔沙(shā )尔德(🆖)的指挥官·(💵)加尔(ěr )格，注意(🏵)到弗图亚使用的(🚳)箭头是(shì )由“自律(lǜ )思考(kǎo )金(jīn )属体(tǐ )·纳(nà )米金属”所制造而欢喜。这和21世纪他们在(🏝)富士山麓作为“对(duì )(🐆)哥斯拉(🏘)决战兵器”所开发、在启动(dòng )前遭到破坏的“机械哥(🎷)斯拉”由同(🀄)种物质所(suǒ )构成。这正(zhèng )是当时(🤫)的开发设备(⏱)至今(jīn )仍然残(🐢)存的证明(míng )——。